Тут впервые в жизни увидел, как производительность CPU может зависеть от версии BIOS материнской платы (S5000PAL, если что, платформа Intel SR1500)
После перепрошивки BIOS на актуальную версию получили прирост производительности на порядок, или более (кроме шуток). Т.е. “сверхзагруженный” сервер после этого чудесным образом стал походить на своих нормальных незагруженных товарищей.
А труднее всего во всёй этой котовасии было локализовать источник проблемы.